есть смысл выковыривать что то отсюда, или при наличии бекапа базы, установить 3.4.5 с нуля и просто влить бекап скула?
Есть смысл дропнуть всё и залить новый дистрибутив (если просто перезалить форум, шеллы останутся), удалив из базы все вирусы (обычно они хранятся в таблице хуков, иногда и в шаблонах). Минус - потеряете вложения форума. Можно оставить папку /uploads/, но нужно иметь ввиду что там тоже могут быть вирусы, и ее нужно просканировать на подозрительные php файлы. Модули придется переустановить, так же, как и кастомные шаблоны. После всей процедуры сменить пароли от бд, фтп и аккаунтов администраторов.