Как поменять основное зеркало сайта на лицензионном IPS 4 без существенных потерь? Каков на сегодняшний день наиболее верный порядок действий? Рекомендации везде отличаются, да и гугл с яндексом постоянно что-то меняют.

301 рекдирект

 

https://yandex.ru/support/webmaster/yandex-indexing/site-mirrors.xml

https://yandex.ru/support/webmaster/yandex-indexing/moving-site.xml

А какая должна быть запись в .htaccess?

Напрашивается вопрос - а после смены главного зеркала надо в Client Area менять домен, привязанный к лицензии? И допустимо ли это?

А что вы подрозумеваете под главное зеркало - смена домена или www домена? При смене другого домена нужно указать его в КЦ.

Смену домена. Не www. Но старый домен тоже является зеркалом этого же сайта.