В одной категории 2 форума. Новые темы там и сообщения в них, перестали показываться по запросу - "Новые сообщения". Со всех остальных форумов показываются, а оттуда нет. В чём может быть проблема ?

Настройки поиска посмотрите. Там есть настройка, которая исключает для поиска "новые сообщения" определенные форумы

Вышел из ситуации переносом всех тем в новый форум. Но спасибо за совет, потому что давно уже искал такую опцию !